現在,人工只能技術如火如荼,無人駕駛百家爭鳴。當我們開始暢想未來科技的可能性時,是完全無人駕駛的汽車、也可能是人工智能技術加持的智能機器人。但現在,有一項看似普通卻蘊含無限可能的技術正在悄然改變我們的世界——基因測序。在肉眼不可見的DNA分子中,隱藏著生命的奧秘。基因測序能夠讓我們有能力去探索DNA所蘊藏的奧秘,有助于人類對自己的身體進行更加深入地了解。隨著科技的進步,基因測序的技術也正以前所未有的速度發展。
第一眼DNA
DNA,生物體內的一種復雜的化學物質,它以雙螺旋的結構存在,構成了細胞的染色體,承載著傳遞生物遺傳信息的任務。DNA是以雙螺旋結構存在于我們身體的細胞中,雙螺旋結構寬僅為2納米。舉一個直觀的例子,頭發絲的直徑大約是兩萬納米。雖然DNA的寬度很小,但是其長度很大。蘊含人類所有遺傳信息的DNA分子,拉直后長度大約是兩米。
在19世紀,科學家們開始分離和研究細胞的化學成分,探索更加微小的物質結構和功能。DNA的發現是這一時期生物學的重要突破,為現在生命科學的多個領域進展打下了基礎。具有如此重要地位的DNA,我們獲得的第一幅它的照片是什么樣的呢?
第一個發現DNA的人是瑞士化學家弗雷德里希·米歇爾(Friedrich Miescher,1844-1895)。1869年,他在研究生物體的組成時,發現了一種他稱為“核蛋白”的物質(也就是DNA),他發現這類物質和其他的蛋白質特性完全不同。在米歇爾發現DNA后,生物學家們紛紛開始研究與猜測DNA的結構,受限于當時的顯微技術,人們還沒有足夠強大的顯微鏡去直接觀察DNA的結構,只能靠間接做實驗的方式去破解DNA的結構。
直到1952年,一種被稱為X射線衍射的技術,將DNA結構展示在人們面前。什么是X射線衍射技術呢?舉個例子,在黑夜中有一個物體,沒有燈光,但是有一堆能發出微弱光芒,被眼睛看到的小球,如何知道物體的形狀具體長什么樣呢?拿起小球朝著那個未知形狀的物體砸去,小球碰到物體后會被彈開,只要砸的小球足夠多,物體的周圍就會分布著許許多多可以被看見的小球,這些小球的位置分布是跟物體形狀有關聯的,通過觀察發光小球的分布,就能夠反推出物體的結構。X射線衍射技術就是這樣,X射線是有非常微小的粒子組成的,利用這些粒子去撞擊DNA,然后再被彈到接收屏上,就能夠反推DNA的結構。
(左圖:富蘭克林;右圖:世界上首張DNA的X光衍射圖片,圖源:Wikipedia)
這一工作由物理學家富蘭克林在1953年完成。這一照片成功證實了兩位生物學家沃森與克里克所假設的DNA結構。
基因測序,具體分幾步
隨著研究的深入,人們發現DNA由四種結構更小的物質構成,我們稱其為堿基。這些堿基之間互相匹配,連接在一起,形成了DNA,而這些堿基的排列順序就蘊藏著遺傳信息,堿基對的特定排列方式叫做基因,其中蘊含著控制生物各種形狀的信息。基因測序,就是要讀出堿基對的排列方式。
基因測序大致可以分為如下幾步:
第一步,從細胞中提取DNA,并去除其他的雜質。
第二步,將較長的DNA打斷為較短的片段,這樣做是因為太長的DNA不好操作。
(DNA片段示例,圖源:作者自制)
第三步,將DNA片段固定在適配器上,并進行復制,增加數量,方便后續進行測序。
(圖源:作者自制)
第四步,也是最重要的一步。首先,是將將堿基對拆開,讓雙螺旋變得只剩下一邊。
(圖源:作者自制)
然后就能換上可發光的特制堿基,利用顯微鏡觀察堿基對的結合,讀出基因序列。能夠這樣做的原因是,堿基對的結合有一定的規則,A堿基總是與T堿基配對,C堿基總是與G堿基配對。并且只有前一個配對完成后,下一個才能開始配對。
這種規則也使得我們能夠間接讀出堿基對的排列順序。生物學家們發明了特別的堿基,這些堿基在與單螺旋上的堿基相結合時,會發出不同顏色的光。將適配器(固定有堿基序列的特制薄片)電腦記錄顯微鏡視角下DNA所發出光的顏色以及順序,就能夠讀出DNA的序列了,也就獲得了基因的信息。
(圖源:作者自制)
基因測序的過去、現在、未來
1965年,測量每個堿基對的順序大約需要1000英鎊;1975年,花費變為需要10英鎊。在1995年,每個字母只需要1英鎊。2000年人類基因組計劃達到頂峰時,每個字母的排序花費大約是0.1英鎊。技術的發展使得測序成本急劇降低,使得人類能進行DNA的大規模測序研究。
現在,已經有公司提供了面向個人的基因測序服務,針對一部分現在已經知曉的一些疾病,通過DNA篩查能夠提前發現并做出相應預防措施。
未來隨著人類對基因的了解越加深入,基因將助力對人類認識更好地自身,提高健康水平,推動生命科學、醫學、生物技、制藥業、農業等各方面的發展。也許,通過對DNA的不斷研究,我們真的能讓一些已經滅絕的動植物重現在地球上。
參考文獻:
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作者:吳慶中國科學院長春光學精密機械與物理研究所 研究生
審核:劉志瑾 首都師范大學生命科學學院生命科學專業學科負責人 教授
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